Doctorat
Le programme de doctorat de l’EUR UNITEID propose cinq à six allocations doctorales par an, attribuées sur concours, pour le financement ou le co-financement de thèses d’une durée de trois ans, ainsi que le financement d’une quatrième année de thèse. Les étudiants devront être inscrits en doctorat à Toulouse, et réaliser leur thèse dans un laboratoire partenaire de l’EUR. Les co-supervisions internationales et les co-tutelles sont vivement encouragées.
Le programme doctoral de l’EUR UNITEID est coordonné avec les Masters et implique deux écoles doctorales de l’Université de Toulouse : Biologie, Santé, Biotechnologie (BSB) et Sciences Ecologiques, Vétérinaires, Agronomiques, et Bio-ingénieries (SEVAB).
La réalisation d’un doctorat dans le cadre de l’EUR est conditionnée à son caractère transversal, dans un objectif de formation interdisciplinaire. La sélection est faite par le Comité d’Évaluation de l’EUR lors d’un concours d’admission organisé chaque année, et dépend à la fois de l’excellence du candidat, ainsi que de la nature transdisciplinaire du projet.
UNITEID regroupe des équipes de recherche de haut niveau impliquées notamment sur les maladies infectieuses prioritaires/émergentes suivantes : Grippe aviaire, Poxvirus, tuberculose, VIH, VHE, SARS-CoV-2, Zika, Bornavirus, Prions, Paludisme, sur la résistance aux antimicrobiens, ainsi que des équipes de recherche en épidémiologie. UNITEID dispose de plateaux techniques de pointe incluant des laboratoires BSL3, de la zootechnie pour les MIE (EquipEx Aninfimip), des plateformes Omics (Genotoul) et d’Intelligence Artificielle (ANITI).
Les thèses déposées dans le cadre de la graduate school UNITEID.

Évaluation de l’apport de la métagénomique clinique par 3ème génération de séquençage pour l’identification de virus émergents
Les maladies virales représentent un risque sanitaire de premier plan, chez l’homme et l’animal. L’identification et le typage rapide et robuste des agents viraux est une priorité scientifique et médicale et fait appel à des « pipelines » qui associent

Des hôtes aux pathogènes : Surveillance génomique One Health de la dynamique du microbiome lié au commerce de la viande de brousse en Afrique
Ce projet de thèse explore les maladies zoonotiques émergentes au sein des systèmes socio-écologiques, en mettant particulièrement l’accent sur les réseaux de viande de brousse en Afrique de l’Ouest. En se concentrant sur la dynamique écologique et épidémiologique de deux

Étude des mécanismes d’antibiotolérance et de persistance chez les entérobactéries
Ce projet aborde directement la menace que représentent les maladies infectieuses émergentes en étudiant les souches d’ Escherichia coli résistantes aux antibiotiques et associées à des infections difficiles à traiter. La tolérance et la persistance constituent des défis cliniques :

Axonogénèse dans la tuberculose pulmonaire : caractérisation de l’innervation, des cellules de Schwann et de leurs rôles fonctionnels
La tuberculose figure parmi les maladies infectieuses prioritaires en raison de son impact mondial, du risque de réactivation et de la résistance aux médicaments. En étudiant les mécanismes neurologiques et immunitaires, en particulier les interactions entre les cellules de Schwann,
Les aides
Bourses de Doctorat
L’EUR UNITEID a la possibilité de financer ou de co-financer des allocations doctorales d’une durée de trois ans. A cet effet, un concours d’admission est organisé chaque année au mois de juillet. Des aides aux mobilités entrantes comme sortantes sont par ailleurs proposées.
Les étudiants devront être inscrits en doctorat à Toulouse, et réaliser leur thèse dans un laboratoire partenaire de l’EUR. Les cotutelles internationales sont vivement encouragées.
Conformément aux objectifs de la stratégie nationale d’accélération sur Maladies Infectieuses Émergentes (MIE) et les menaces NRBC (menaces nucléaires, radiologiques, biologiques et chimiques), le périmètre d’éligibilité des financements est restreint au champ de l’EUR, à savoir les MIE et l’antibiorésistance, et ne couvre donc pas toute l’infectiologie, la microbiologie, ou l’épidémiologie des maladies infectieuses non-émergentes / non-prioritaires. Cette adéquation au champ de l’EUR est un prérequis pour la recevabilité des demandes de financement.

Allocations doctorales 2026 : UNITEID lance son appel à projets
L’EUR UNITEID lance son appel à projets pour l’attribution d’allocations doctorales destinées à soutenir des travaux de recherche interdisciplinaires dans le domaine des maladies infectieuses émergentes et de l’antibiorésistance. Cet appel s’adresse aux étudiants souhaitant porter un projet de recherche